Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms