Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms