Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp5P56399 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms