Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms