Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acod1P54987 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms