Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Faf1P54731 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms