Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms