Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacnb3P54285 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacnb3P54285 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms