Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms