Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx4P53776 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx4P53776 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx4P53776 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx4P53776 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx4P53776 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx4P53776 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx4P53776 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx4P53776 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx4P53776 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lhx4P53776 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhx4P53776 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhx4P53776 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhx4P53776 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lhx4P53776 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms