Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PklrP53657 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PklrP53657 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PklrP53657 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PklrP53657 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PklrP53657 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PklrP53657 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PklrP53657 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PklrP53657 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PklrP53657 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PklrP53657 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PklrP53657 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms