Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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