Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms