Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms