Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorcP51450 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorcP51450 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorcP51450 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorcP51450 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorcP51450 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RorcP51450 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorcP51450 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorcP51450 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms