Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs7P50715 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms