Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SftpdP50404 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SftpdP50404 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms