Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms