Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc13P50207 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms