Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnni3P48787 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3P48787 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3P48787 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3P48787 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3P48787 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3P48787 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3P48787 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms