Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms