Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a1P43024 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms