Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbP41155 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LtbP41155 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LtbP41155 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LtbP41155 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms