Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tjp1P39447 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms