Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik2P39087 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms