Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbl1P39039 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbl1P39039 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms