Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn1P35821 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn1P35821 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms