Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddit3P35639 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ddit3P35639 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddit3P35639 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms