Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms