Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms