Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms