Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms