Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms