Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsx2P31316 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms