Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd3P30282 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms