Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msr1P30204 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msr1P30204 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms