Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VtnP29788 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VtnP29788 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VtnP29788 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms