Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp1P29452 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms