Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp3P28862 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp3P28862 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms