Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RxraP28700 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RxraP28700 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RxraP28700 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RxraP28700 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RxraP28700 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RxraP28700 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RxraP28700 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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