Protein–RNA interactions for Protein: P28652

Camk2b, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2bP28652 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Camk2bP28652 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Camk2bP28652 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms