Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjc1P28229 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms