Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms