Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af2P26369 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af2P26369 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af2P26369 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms