Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CftrP26361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CftrP26361 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CftrP26361 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CftrP26361 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CftrP26361 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CftrP26361 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CftrP26361 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CftrP26361 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CftrP26361 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CftrP26361 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CftrP26361 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CftrP26361 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms