Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou2f1P25425 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms