Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms