Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd247P24161 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd247P24161 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms