Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms