Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd11P23813 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd11P23813 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms